По словам главного продюсера FIFA 16 Себастьяна Энрике, работа по включению в игру женских команд была начата два года назад. При разработке первого прототипа в игру добавили женские персонажи из другой спортивной игры - Grand Slam Tennis 2, что позволило оценить перечень необходимых изменений, связанных с реалистичным отображением движений, а также внешнего вида спортсменок. Женский футбол визуально сильно отличается от мужского, в связи с этим разработчики поставили перед собой задачу добиться реалистичного отображения игрового процесса. Впоследствии выяснилось, что основной проблемой стали вопросы логистического и лингвистического характера.

Первая проблема связана с тем, что игроки женских национальных сборных не так вовлечены в спортивную жизнь, как мужчины, и зачастую футбол не является для них основной профессией. По этой причине поиск лучших женщин-игроков мира для участия в разработке игры стал чуть ли не основной задачей EA Canada при разработке FIFA 16.

Разработчикам также пришлось учесть необходимость адекватного отображения языковых особенностей женского и мужского рода при озвучке и визуальном оформлении игры.